L'Amministrazione centrale è articolata in nove Dipartimenti per lo svolgimento organico e integrato delle funzioni della Banca.
I Dipartimenti si compongono di Servizi che curano le attività specialistiche, amministrative e tecniche. I Servizi sono costituiti da Divisioni.
Le funzioni di audit, legale e di Autorità nazionale di risoluzione sono alle dirette dipendenze del Direttorio.
La programmazione e il coordinamento delle attività sono assicurati anche da comitati con funzioni consultive, decisionali o di controllo.